Predloga:Infopolje Bio podatkovna baza/dok

GenBank
Vsebina
Opis	GenBank, baza podatkov NIH o genskih zaporedjih
Tipi zajetih; podatkov	nukleotidno zaporedje, proteinsko zaporedje
Organizmi	vsi
Kontakt
Raziskovalni center	NCBI - nacionalni center za biotehnološke informacije
Glavni citat	PubMed
Dostop
Formati podatkov	XML; ASN.1; Genbank format
Spletna stran	NCBI
URL za prenos	ncbi ftp
Web service URL	eutils; soap
Orodja
Web	BLAST
Samostojno	BLAST
Razno
Licenca	licenca za javno domeno - vlada ZDA
Zaznamovanje; postavk	da

To je dokumentacijska podstran za glavno stran Predloga:Infopolje Bio podatkovna baza.
Namenjena je shranjevanju navodil, kategorizaciji in drugi vsebini, ki ni del glavne strani.

Uporablja Lua:

Infopolje se uporablja za opis biološke podatkovne baze.

Prosimo, da ne pozabite dodati članek v Kategorija:Biološke podatkovne zbirke .

Polja uredi

Vsebina uredi

title: naslov, npr. FusariumDB
description:kratek opis npr.: Kiber infrastruktura za Fusarium
scope: Področje, kot na primer: nukleotidno zaporedje, zaporedje RNK, beljakovinsko zaporedje, struktura, genomika (nevretenčarji), presnovne in signalne poti, človeški genom in genomi drugih vretenčarjev, človeški geni in bolezni, podatki mikromrež in drugih genskih izrazov, proteomski resursi, ostala molekularna biologija, organela, rastlina, imunološko ......
organism: eden ali več organizmov, značilni za to bazo podatkov

Kontakt uredi

center ali centre: raziskovalni center npr NCBI - nacionalni center za biotehnološke informacije
laboratory: laboratorij
author: avtor(ji) te baze podatkov
citation: glavni citat za članek, ki bazo podatkov opisuje (kot alternativa se lahko uporabi pmid= za PubMed ID, vendar ne uporabiti obeh možnosti)
pmid: PMID za članek, ki bazo podatkov opisuje (kot alternativa se lahko uporabi citation=, vendar ne uporabiti obeh možnosti)
released: datum objave

Dostop uredi

standard: MIji, formati za podatke
format: formati za podatke
sql: če je baza podatkov dostopna kot javni strežnik SQL(koristna možnost je URL za dokumentacijo o bazi podatkov)
webservice: če za bazo podatkov obstaja web service (recimo kot URL, ki kaže na datoteko WSDL).
sparql: sparql končna točka/točke, če obstaja(jo)
download: področje za prenose, FTP naslov...

Orodja uredi

webapp: Web aplikacija(e)
standalone: Ssamostojno orodje(a)

Razno uredi

versioning: stališče glede različic/dostopa do zastarelih podatkov
license: licenca za podatke.
frequency: pogostnost obnavljanja podatkov
curation: stališče glede kuratiranja
version: različica objave
bookmark: Postavko je mogoče v tej bazi podatkov zaznamovati (http metoda GET)

Model uredi

{{Infopolje Bio podatkovna baza
|title =
|logo =
|description = 
|scope = 
|organism = 
|center = 
|laboratory = 
|author = 
|citation = 
|released = 
|standard = 
|format = 
|url = 
|download = 
|webservice = 
|sql = 
|sparql = 
|webapp = 
|standalone = 
|license = 
|versioning = 
|frequency = 
|curation = 
|bookmark =
|version =
}}

Zgled uredi

{{Infopolje Bio podatkovna baza
| title = [[GenBank]]
| author =
| center = [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]
| organism = vsi
| description = GenBank, baza podatkov NIH o genskih zaporedjih 
| scope = nukleotidno zaporedje, proteinsko zaporedje
| url = [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ NCBI]
| download = [ftp://ftp.ncbi.nih.gov/ ncbi ftp]
| webservice = [http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/ eutils]<br/>
               [http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/eutils.wsdl soap]
| license = licenca za javno domeno - vlada ZDA
| pmid = 21071399
| logo = [[File:US-NLM-NCBI-Logo.svg|60px]]
| standalone=[[BLAST]]
| webapp=[[BLAST]]
| format= [[XML]]<br/>[[ASN.1]]<br/>Genbank format
| bookmark=da
}}