Baškirski naravni rezervat se nahaja na južnem koncu [[Ekoregija|ekoregije]] z imenom [[Uralska montanska tundra in tajga]], ki je točka na kateri se srečajo evropski in azijski rastlinski pasovi. (WWF ID#610).<ref name="ecomap">{{cite web|title=Map of Ecoregions 2017|url=https://ecoregions2017.appspot.com/|publisher=Resolve, using WWF data|language=en|access-date=September 14, 2019}}</ref> Podnebje rezervatabaškirskega Baškirrezervata je [[Subarktično podnebje|vlažno borealno podnebje s svežim poletjem]] ([[Köppnova podnebna klasifikacija|Köppnova podnebna klasifikacija dfc]]). Za to podnebje so značilna blaga poletja (le 1-3 mesece nad 10°C) in hladne, snežne zime (najhladnejši mesec pod –3°C).<ref name="kop">{{cite web|author=Kottek, M., J. Grieser, C. Beck, B. Rudolf, and F. Rubel, 2006|title=World Map of Koppen-Geiger Climate Classification Updated|url=http://koeppen-geiger.vu-wien.ac.at/pdf/Paper_2006.pdf|publisher=Gebrüder Borntraeger 2006|language=en|access-date=September 14, 2019}}</ref><ref name="kop-data">{{cite web|title=Dataset - Koppen climate classifications|url=https://datacatalog.worldbank.org/dataset/world-maps-k%C3%B6ppen-geiger-climate-classification|publisher=World Bank|language=en|access-date=September 14, 2019}}</ref>
