Testiranje na covid-19: Razlika med redakcijama

Izbrisana vsebina Dodana vsebina
Vitosmo (pogovor | prispevki)
mBrez povzetka urejanja
Vitosmo (pogovor | prispevki)
Ustvarjeno s prevodom strani »COVID-19 testing«
Vrstica 44:
Z verižno reakcijo s polimerazo za reverzno transkripcijo v realnem času (rRT-PCR) <ref name="20200130cdc">{{Navedi splet|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/summary.html|title=2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) Situation Summary|date=30 January 2020|website=[[Centers for Disease Control and Prevention]]|archiveurl=https://web.archive.org/web/20200126210549/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/summary.html|archivedate=26 January 2020|accessdate=30 January 2020}}</ref> se lahko test opravi na dihalnih vzorcih dihal, dobljenih na različne načine, tako z nazofaringealnim brisom ali iz vzorca [[Izmeček|izpljunka]] . <ref name="20200129cdc">{{Navedi splet|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/rt-pcr-detection-instructions.html|title=Real-Time RT-PCR Panel for Detection 2019-nCoV|date=29 January 2020|website=[[Centers for Disease Control and Prevention]]|accessdate=1 February 2020|archiveurl=https://web.archive.org/web/20200130202031/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/rt-pcr-detection-instructions.html|archivedate=30 January 2020}}</ref> Rezultati so običajno na voljo v nekaj urah do dveh dneh. <ref name="globenewswire1977226">{{Navedi splet|url=https://www.globenewswire.com/news-release/2020/01/30/1977226/0/en/Curetis-Group-Company-Ares-Genetics-and-BGI-Group-Collaborate-to-Offer-Next-Generation-Sequencing-and-PCR-based-Coronavirus-2019-nCoV-Testing-in-Europe.html|title=Curetis Group Company Ares Genetics and BGI Group Collaborate to Offer Next-Generation Sequencing and PCR-based Coronavirus (2019-nCoV) Testing in Europe|date=30 January 2020|website=GlobeNewswire News Room|accessdate=1 February 2020|archiveurl=https://web.archive.org/web/20200131201626/https://www.globenewswire.com/news-release/2020/01/30/1977226/0/en/Curetis-Group-Company-Ares-Genetics-and-BGI-Group-Collaborate-to-Offer-Next-Generation-Sequencing-and-PCR-based-Coronavirus-2019-nCoV-Testing-in-Europe.html|archivedate=31 January 2020}}</ref> Molekularne metode uporabljajo [[Verižna reakcija s polimerazo|verižno reakcijo s polimerazo]] (PCR) skupaj s preskusi nukleinske kisline in drugimi naprednimi analitičnimi tehnikami, s katerimi se v realnem času za diagnostične namene dokaže prisotnost genetskega materiala virusa.
[[Slika:Cycler_offen.JPG|alt=Thermocycler|sličica| Naprava Ciklični termostat, ki se običajno imenuje PCR stroj. ]]
En prvih testov PCR, ki so ga razvili v CharitéCharitéj v Berlinu januarja 2020; uporablja verižno reakcijo s polimerazo za povratno transkripcijo v realnem času (rRT-PCR), na njem temelji 250.000 naprav, ki jih daje na voljo [[Svetovna zdravstvena organizacija|Svetovna zdravstvena organizacij]]<nowiki/>a (WHO). <ref name="sheridan">{{Navedi revijo|last=Sheridan|first=Cormac|title=Coronavirus and the race to distribute reliable diagnostics|url=https://www.nature.com/articles/d41587-020-00002-2|journal=Nature Biotechnology|language=en|doi=10.1038/d41587-020-00002-2|date=19 February 2020}}</ref>
 
Južnokorejsko podjetje Kogenebiotech je 28. januarja 2020 obvestilo javnost, da je razvilo za klinične potrebe aparat kompleta za odkrivanje SARS-CoV-2 na osnovi PCR ( ''PowerChek Coronavirus''). <ref>{{Navedi splet|url=http://www.kogene.co.kr/eng/index.php|title=KogeneBiotech (Homepage)|publisher=Kogene.co.kr|date=|accessdate=2020-03-16}}</ref> <ref>{{Navedi novice|last=Jeong|first=Sei-im|title=Korea approves 2 more COVID-19 detection kits for urgent use - Korea Biomedical Review|url=http://www.koreabiomed.com/news/articleView.html?idxno=7561|accessdate=12 March 2020|work=www.koreabiomed.com|date=28 February 2020|language=ko}}</ref> Osredotoča se na gen "E", ki je svojski vsem beta koronavirusom, in na gen RdRp, ki je značilen za SARS-CoV-2. <ref>{{Navedi splet|url=http://www.kogene.co.kr/eng/about_us/news/listbody.php?h_gcode=board&h_code=7&po_no=288|title=ABOUT US &#124; NEWS}}</ref> Druga podjetja so ravno tako javila testne pripomočke za ta namen, , na primer Solgent in Seegene, ki sta februarja 2020 objavila različice kompletov za kliniko po imenu ''DiaPlexQ'' in ''Allplex 2019-nCoV Assay'' .
Vrstica 50:
Na Kitajskem je bila BGI Group eno prvih podjetij, ki je od kitajske nacionalne uprave za medicinske izdelke dobilo zasilno dovoljenje za komplet za odkrivanje SARS-CoV-2 na temelju PCR. <ref>{{Navedi splet|url=https://www.genomeweb.com/regulatory-news-fda-approvals/bgi-sequencer-coronavirus-molecular-assays-granted-emergency-use|title=BGI Sequencer, Coronavirus Molecular Assays Granted Emergency Use Approval in China|website=GenomeWeb|language=en-us|accessdate=2020-03-09}}</ref>
 
Centri za nadzor in preprečevanje bolezni v ZDA nudijo laboratorijem diagnostični test ''CDC 2019-Novel Coronavirus (2019-nCoV)'' na osnovi rRTRT-PCR v realnem času <ref>{{Navedi splet|url=https://www.internationalreagentresource.org/|title=International Reagent Resource > Home|website=www.internationalreagentresource.org}}</ref> Eden od treh genetskih testov v starejših različicah kompletov je zaradi okvarjenih reagentov dajal nezanesljive rezultate in zaradi tega zadrege in zamud v CDC v Atlanti; v februarju 2020 so zaradi tega dnevno lahko obdelali manj kot 100 vzorcev. Preizkusi z dvema komponentama niso bili zanesljivi, tako da je šele 28. februarja 2020 [[Food and Drug Administration|Uprava]] za [[Food and Drug Administration|hrano in zdravila]] (FDA) na osnovi zakonodaje državnim in lokalnim laboratorijem na osnovi zakonodaje za izjemne razmere dovolila. <ref>[https://www.cdc.gov/media/releases/2020/t0228-COVID-19-update.html Transcript for the CDC Telebriefing Update on COVID-19], Feb 282020</ref> test je odobrila.
 
Ameriški komercialni laboratoriji so začeli testirati v začetku marca 2020. 5. marca 2020 je LabCorp sporočil, da ima na voljo testni komplet za COVID-19 na temelju RT-PCR. <ref>{{Navedi splet|url=https://ir.labcorp.com/news-releases/news-release-details/labcorp-launches-test-coronavirus-disease-2019-covid-19|title=LabCorp Launches Test for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)}}</ref> Quest Diagnostics je podobno javil, da bodo od 9. marca 2020 dalje po vsej državi na voljo kompletni testi COVID-19 . <ref>{{Navedi splet|url=https://www.questdiagnostics.com/home/Covid-19/|title=Covid19 : COVID-19|website=www.questdiagnostics.com}}</ref> O omejitvah glede količin niso poročali; jemanje in obdelava vzorcev morata potekati v skladu z zahtevami CDC.
Vrstica 66:
=== Zaznavanje protiteles ===
Del imunskega odziva na okužbo je [[Protitelo|tvorba protiteles,]] med drugim IgM in IgG. Ti proteini se lahko uporabijo za odkrivanje okužb pri posameznikih, za ugotavljanje imunosti in pri nadzor javnega zdravja.  
<sup class="noprint Inline-Template Template-Fact" data-ve-ignore="true" style="white-space:nowrap;">&#x5B; ''<nowiki><span title="This claim needs references to reliable sources. (March 2020)">navedba potrebna</span></nowiki>'' &#x5D;</sup>
 
Teste lahko opravimo v centralnih laboratorijih (Central Laboratories Testing - CLT) ali na mestu samem (Point-of-Care Testing - PoCT).. Avtomatizirani sistemi z visoko prepustnostjo bodo v mnogih kliničnih laboratorijih lahko opravljali te teste, vendar bo najprej morala steči njih proizvodnja. Za CLT se običajno uporablja en sam vzorec periferne krvi, čeprav se za zasledovanje imunskega odziva lahko uporabljajo serijski vzorci. Za PoCT se običajno jemlje s punkcijo en sam vzorec krvi. Za razliko od PCR pred preizkusom ekstrakcija ni potrebna.
<sup class="noprint Inline-Template Template-Fact" data-ve-ignore="true" style="white-space:nowrap;">&#x5B; ''<nowiki><span title="This claim needs references to reliable sources. (March 2020)">navedba potrebna</span></nowiki>'' &#x5D;</sup>
 
Upati je, da bo v ZDA do 30. marca PoCT na voljo. <ref>{{Navedi splet|last=Commissioner|first=Office of the|title=Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Issues first Emergency Use Authorization for Point of Care Diagnostic|url=https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-issues-first-emergency-use-authorization-point-care-diagnostic|website=FDA|accessdate=23 March 2020|language=en|date=21 March 2020}}</ref>
 
Vrstica 75:
=== CT prsnega koša ===
[[Računalniška tomografija|Pregledi CT]] prsnega koša lahko včasih pomagajo prepoznati in opisati patologijo pljuč; pri okužbi s COVID-19 izvidi niso bili specifični. Sistematični pregled izvidov CT prsnega koša pri 919 bolnikih je značilne zgodnje znake COVID-19 opisal kot "bilateralno multilobarno motnost zmletega stekla (GGO - Ground-Glass Opacification) s periferno ali posteriorno porazdelitvijo". <ref>{{Navedi revijo|last=Salehi|first=Sana|last2=Abedi|first2=Aidin|last3=Balakrishnan|first3=Sudheer|last4=Gholamrezanezhad|first4=Ali|date=2020-03-14|title=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): A Systematic Review of Imaging Findings in 919 Patients|journal=American Journal of Roentgenology|language=en|pages=1–7|doi=10.2214/AJR.20.23034|pmid=32174129|issn=0361-803X}}</ref> Ena od raziskav je pokazala, da je občutljivost CT za okužbo s COVID-19 znašala 98% v primerjavi z občutljivostjo za RT-PCR 71%; vendar gre za raziskavo v kitajski provinci Wuhan, ki je ni mogoče posplošiti. <ref name="tazy">{{Navedi revijo|title=Correlation of Chest CT and RT-PCR Testing in Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) in China: A Report of 1014 Cases|publisher=[[Radiological Society of North America]]|first=Tao|last=Ai|first2=Zhenlu|last2=Yang|journal=Radiology|page=200642|date=February 26, 2020|doi=10.1148/radiol.2020200642|pmid=32101510}}</ref> Najpogostejši izvidi CT preiskave so bili bilateralna atenuacija zmletega stekla (neenotna ali difuzna) s subpleuralno dominanco, "crazy paving" strukturo in konsolidacijo na kasnejših stopnjah. <ref>{{Navedi revijo|last=Lee|first=Elaine Y. P.|last2=Ng|first2=Ming-Yen|last3=Khong|first3=Pek-Lan|title=COVID-19 pneumonia: what has CT taught us?|journal=The Lancet Infectious Diseases|date=24 February 2020|volume=0|doi=10.1016/S1473-3099(20)30134-1|pmid=32105641|url=https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30134-1/fulltext|accessdate=13 March 2020|language=English|issn=1473-3099}}</ref> Te ugotovitve so nespecifične in jih najdemo tudi pri drugih vrstah pljučnice. Majhna raziskava je pokazala, da so kitajski radiologi z uporabo CT slikanja ugotovili občutljivost 72-94% in diferenciacijo COVID-19 od drugih vrst virusne pljučnice 24-94%. <ref>{{Navedi revijo|last=Bai|first7=Ian|pmid=32155105|doi=10.1148/radiol.2020200823|pages=200823|date=10 March 2020|journal=Radiology|title=Performance of radiologists in differentiating COVID-19 from viral pneumonia on chest CT|first9=Dong-Cui|last9=Wang|first8=Lin-Bo|last8=Shi|last7=Pan|first=Harrison X.|first6=Thi My Linh|last6=Tran|first5=Ji Whae|last5=Choi|first4=Kasey|last4=Halsey|first3=Zeng|last3=Xiong|first2=Ben|last2=Hsieh|issn=0033-8419}}</ref> Natančnosti in diskriminatorne vrednosti CT testa, ki bi razlikoval COVID od drugih virusnih pljučnic doslej nobena raziskava ni potrdila. Zato CDC od 5. marca dalje CT za začetni presejalni pregled ne priporoča. Osebe s sumom na COVID je treba testirati z RT-PCR, ki je najbolj specifičen test.  
<sup class="noprint Inline-Template Template-Fact" data-ve-ignore="true" style="white-space:nowrap;">&#x5B; ''<nowiki><span title="This claim needs references to reliable sources. (March 2020)">navedba potrebna</span></nowiki>'' &#x5D;</sup><gallery widths="400" heights="200">
 
<br /><gallery widths="400" heights="200">
Slika:COVID19CT2.webp|Značilne slike CT
Slika:COVID19CT1.webp|CT slika v kasnem stadiju bolezni
Vrstica 106 ⟶ 105:
 
== Sklici ==
<references group="" responsive="1"></references>
{{Sklici}}
 
== Zunanje povezave ==
 
* [https://www.c-span.org/video/?470277-1/federal-health-officials-testify-coronavirus-outbreak-response&start=4478 COVID-19 Testiranje (vsaj) - zdaj Brezplačno za vse?] [https://www.c-span.org/video/?470277-1/federal-health-officials-testify-coronavirus-outbreak-response&start=4478 (CDC; ameriški kongres; video CSPAN / 6: 00; 12. marec 2020)]
<nowiki>
[[Kategorija:CS1 viri v jeziku vietnamščina (vi)]]