Senat je najvišji strokovni organ UL Medicinske fakultete. Sestavljajo ga visokošolski učitelji fakultete, ki zasedajo pedagoška delovna mesta negledene glede na to, ali so ta za polni ali krajši delovni čas. Kandidate za senat predlagajo katedre in inštituti UL MF akademskemu zboru, ki jih nato izvoli za štiri leta. Člani senata so tudi študenti UL MF, ki jih imenuje Študentski svet UL MF. Senat razpravlja o in sprejema odločitve o delovanju UL MF in poteku pedagoškega in strokovnega procesa.<ref>Pravilnik o organizaciji in delovanju Medicinske fakultete v Ljubljani (čistopis oktober 2013) http://www.mf.uni-lj.si/dokumenti/f0a0d62318840e2e9e72a938b894f202.pdf</ref>
