Prepisovalni dejavnik: Razlika med redakcijama

Izbrisana vsebina Dodana vsebina
m Yerpo je premaknil(-a) stran Transkripcijski faktor na Prepisovalni dejavnik: slovenjenje po http://bio.ijs.si/SBD/terminologija.html#T
m slog
Vrstica 1:
'''TranskripcijskiPrepisovalni dejavnik''' (s tujko '''transkripcijski faktor'''( je [[beljakovina]], ki je potrebna za pričetek [[transkripcija|transkripcije]] (prepisovanja), vendar ni del polimeraznega kompleksa. Veže razpoznavni element [[DNK]]. Preko protein-protein interakcij sodeluje z drugimi transkripcijskimiprepisovalnimi faktorjidejavniki, s [[s transkripcijo povezani faktor|transkripcijo povezanimi faktorji]] (TAFi)]] ali z [[RNK-polimeraza|RNK-polimerazo]]. Ločimo dva splošna tipa transkripcijskihprepisovalnih faktorjevdejavnikov:
* bazalne transkripcijskeprepisovalne faktorjedejavnike ter
* faktorje, ki kontrolirajo izražanje posameznih [[gen]]ov in so zato odgovorni za uravnavanje genske ekspresije.
 
TranskripcijskiPrepisovalni faktorjidejavniki so potrebni za pričetek prepisovanja z določenega [[promotor]]ja ali niza [[promotor]]jev. Sestavljeni so iz več funkcionalnih domen.
 
== StrukturaZgradba in funkcija transkripcijskih faktorjev ==
Najbolje preučevani transkripcijskiprepisovalni faktorjidejavniki so transkripcijski aktivatorji. Le-ti se vežejo na regulatorna [[DNK]]-zaporedja in stimulirajo prepisovanje. Na splošno naj bi bili ti faktorjidejavniki sestavljeni iz dveh domen; ena regija proteina se specifično veže na DNK, druga pa aktivira transkripcijo z interakcijo ostalih komponent [[transkripcijske mašinerije]]. Osnovna funkcija DNK vezavne domene je »zasidranje« transkripcijskihprepisovalnih faktorjevdejavnikov na pravilno mesto DNK; aktivacijska domena nato neodvisno stimulira transkripcijo s povezovanjem ostalih proteinovbeljakovin. Mnogo DNK vezavnih domen teh proteinovbeljakovin je sorodnih. Domene, imenovane [[cinkov prst|cinkovi prsti]], vsebujejo ponovitve [[cistein]]skih in [[histidin]]skih ostankov, ki vežejo [[cink]]ove ione in se pri tem zvijejo v »zankasto« strukturo (»prst«), ki veže DNK. Te domene so odkrili pri [[TFIIIA]] in [[Sp1]].
 
Pri [[evkarionti]]h so med beljakovinami tipa [[vijačnica-zavoj-vijačnica]] proteini tudi homeodomenskihomeodomenske proteinibeljakovine, ki imajo pomembno vlogo pri uravnavanju genskega izražanja med embrionalnim razvojem. Dve ostali družini DNK-vezavnih proteinovbeljakovin sta [[levcinska zadrga]] in beljakovine tipa [[vijačnica-obrat-vijačnica]] proteini, ki vsebujejo DNK-vezavno domeno, ki nastane z dimerizacijo dveh [[polipeptid]]nih verig. Levcinska zadrga vsebuje 4 ali 5 levcinskih ostankov, kar rezultira v hidrofobnih stranskih verigah, ki so izpostavljene na eni strani helikalne regije. Te regije služijo kot dimerizacijske domene za dve proteinski podenoti, ki skupaj vzdržujejo hidrofobne interakcije med levcinskimi stranskimi verigami. Takoj po levcinski zadrgi je regija bogata s pozitivno nabitimi aminokislinami ([[lizin]] in [[arginin]]), ki vežejo DNK. VijačnicaBeljakovine vijačnica-obrat-vijačnica proteini imajo podobno strukturo, vendar se pri njih dimerizacijski domeni tvorita z helikalnimi regijami, ki sta ločeni z zavojem. Pomembno je namreč tudi dejstvo, da različni člani teh dveh družin (levcinska zadrga in vijačnica-obrat-vijačnica) lahko dimerizirajo med seboj. Nekatere aktivacijske domene, imenovane, »kisle aktivacijske domene«, so bogate z negativno nabitimi ostanki ([[aspartat]] in [[glutamat]]), drugi pa so bogati vs [[prolin]]skihskimi in [[glutamin]]skihskimi ostankihostanki. Te aktivacijske domene naj bi uravnavale transkripcijo tako, da interagirajo z bazalnimi transkripcijskimiprepisovalnimi faktorjidejavniki (npr. [[TFIIB]] ali [[TFIID]]). Tako naj bi omogočili združitev transkripcijskega kompleksa na promotor .<ref>[http://AtlasGeneticsOncology.org/Educ/TFactorsEng.html 1]</ref>
 
[[Gen]]i, ki jih prepiše [[RNK-polimeraza II]], imajo dva jedrna promotorja, [[TATA]] box in [[Inr]]-zaporedje, ki služita kot specifični vezavni mesti za transkripcijske faktorje. Ostala cis-delujoča regulatorna zaporedja služijo kot vezavna mesta za širok spekter regulatornih faktorjev, ki uravnavajo izražanje posameznih genov. Ta zaporedja se po navadi nahajajo navzgor od TATA box-a. Dve zelo pogosti zaporedji sta CCAAT in GGGCGG, imenovani GC box <ref>[http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=146010 2]</ref>. V nasprotju z omenjenimi zaporedji so nekatera zaporedja oddaljena mnogo dlje od transkripcijskega začetnega mesta (včasih več kot 10 [[bazni par|kilobaz]]). Ta zaporedja imenujemo »ojačevalci« (»enhancers«). Ojačevalci, tako kot promotorjupromotorji, delujejo tako, da vežejo transkripcijskiprepisovalni faktordejavnik, ki nato regulira RNK-polimerazo. To je možno zaradi tega, ker je DNK zvita. Vezava specifičnega transkripcijskegatranskripcijske regulatornegaregulatorne proteinabeljakovine z ojačevalcem regulira gensko izražanje med razvojem in diferenciacijo. Pomembno dejstvo je tudi, da ojačevalci po navadi vsebujejo multifunkcionalne elemente, ki vežejo različne transkripcijske regulatorne proteinebeljakovine. Tak primer najdemo pri imunoglobulinskem ojačevalcu <ref>[http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=331925 3]</ref>
 
== Sklici in opombe ==
{{Opombe}}
 
{{biosci-stub}}