|
'''Kofaktor''' je nebeljakovinska [[spojina]], ki je močno ali šibko vezana na [[protein]] in je potrebna za biološko aktivnost proteina; najpogosteje so ti proteini [[encim]]i. Neaktivni encim, brez kofaktorja, se imenuje [[apoencim]], skupaj s kofaktorjem pa [[holoencim]].<ref name=Metzler>{{cite book |author=Sauke, David J.; Metzler, David E.; Metzler, Carol M. |title=Biochemistry: the chemical reactions of living cells |publisher=Harcourt/Academic Press |location=San Diego |year=2001 |isbn=0-12-492540-5 |edition=2nd}}</ref>
Kofaktor je lahko [[kovina|kovinski]] [[ion]] (npr. [[cink|Zn]]<sup>2+</sup>, [[magnezij|Mg]]<sup>2+</sup> in [[baker|Cu]]<sup>2+</sup>), lahko pa tudi organska ali [[kordinacijska spojina]]; v slednjem primeru imenujemo kofaktor tudi '''koencim'''. Nekateri viri omejujejo termin "»kofaktor"« na anorganske snovi.<ref>{{cite web |url=http://academic.brooklyn.cuny.edu/biology/bio4fv/page/coenzy_.htm |title=Coenzymes and cofactors |accessdate=2009-07-29 |format= |work=}}</ref><ref>{{cite web |url=http://www.elmhurst.edu/~chm/vchembook/571cofactor.html |title=Enzyme Cofactors |accessdate=2009-07-29 |format= |work=}}</ref> Organski kofaktorji so velikokrat [[vitamin]]i ali pa so derivati le-teh. V primeru močne vezave, torej vezave s [[kovalentna vez|kovalentnimi vezmi]], se kofaktor imenuje tudi '''prostetična skupina'''.
Nekateri encimi ali encimski kompleksi potrebujejo za svoje delovanje več kofaktorjev. Primer tega je [[piruvat dehirogenaza]], ki potrebuje za [[oksidacija|oksidacijo]] [[piruvat]]a do [[acetilkoencim A|acetilkoencima A]] več kofaktorjev; [[tiamin difosfat]] (ThDP), [[lipoamid]], [[flavin adenin dinukleotid]] (FAD), magnezijev ion (Mg<sup>2+</sup>) ter kosubstrata [[nikotinamid adenin dinukleotid]] (NAD) in [[koencim A]].<ref>{{cite book |author=Jordan, Frank; Patel, Mulchand S. |title=Thiamine: catalytic mechanisms in normal and disease states |publisher=Marcel Dekker |location=New York, N.Y |year=2004 |page=588 |isbn=0-8247-4062-9 }}</ref>
== Anorganski kofaktor ==
Anorganski kofaktorkofaktorji so v večini primerov kovinski ionioni. Pri človeku so najpogostejši ioni [[železo|železa]], [[mangan]]a, [[kobalt]]a, [[baker|bakra]], [[cink]]a, [[selen]]a in [[molibden]]a.<ref>{{cite journal |author=Aggett PJ |title=Physiology and metabolism of essential trace elements: an outline |journal=Clin Endocrinol Metab |volume=14 |issue=3 |pages=513–43 |year=1985 |pmid=3905079|doi=10.1016/S0300-595X(85)80005-0}}</ref> Čeprav pomanjkanje [[krom]]a povzroči okvarjeno glukozno toleranco, do zdaj ni bil odkriti še nobeden encim, ki bi potreboval kromov ion kot kofaktor.<ref>{{cite journal |author=Stearns DM |title=Is chromium a trace essential metal? |journal=Biofactors |volume=11 |issue=3 |pages=149–62 |year=2000 |pmid=10875302 |doi=10.1002/biof.5520110301}}</ref><ref>{{cite journal |author=Vincent JB |title=The biochemistry of chromium |journal=J. Nutr. |volume=130 |issue=4 |pages=715–8 |year=2000 |pmid=10736319 |url=http://jn.nutrition.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=10736319 |month=Apr |day=01}}</ref> Tudi [[jod]] je pomemben mikroelement, vendar je pogosteje uporabljen kot del strukture [[tiroidni hormon|tiroidnih hormonov]] kot pa kofaktor encimov.<ref>{{cite journal |author=Cavalieri RR |title=Iodine metabolism and thyroid physiology: current concepts |journal=Thyroid |volume=7 |issue=2 |pages=177–81 |year=1997 |pmid=9133680 |doi=10.1089/thy.1997.7.177}}</ref> Naslednji poseben primer je [[kalcij]], ki je potreben za aktivnost mnogih encimov, kot je adenilat kinaza, vendar se pogosto poveže skupaj s [[kalmodulin]]om za [[alosterija|alosterično regulacijo]] encima.<ref>{{cite journal |author=Clapham DE |title=Calcium signaling |journal=Cell |volume=131 |issue=6 |pages=1047–58 |year=2007 |pmid=18083096 |doi=10.1016/j.cell.2007.11.028}}</ref> Tako je kalcij signalna molekula v celicah in se ga ne uvršča med kofaktorje encimov.<ref>{{cite journal |author=Niki I, Yokokura H, Sudo T, Kato M, Hidaka H |title=Ca2+ signaling and intracellular Ca2+ binding proteins |journal=J. Biochem. |volume=120 |issue=4 |pages=685–98 |year=1996 |pmid=8947828}}</ref>
Primeri encimov, ki potrebujejo kovinski ion kot kofaktor:
== Koencim ==
Koencim je majhna organska molekula s tipično maso manj kot 10001.000 [[Enota atomske mase|Da]] ali koordinacijska spojina, ki je na encim vezana s šibkimi interakcijami ali močnimi kovalentnimi vezmi.<ref>{{cite book |author=Palmer, Trevor |title=Understanding enzymes |publisher=Horwood |location=New York |year=1981 |isbn=0-85312-307-1 }}</ref><ref>{{cite book |author=Farrell, Shawn O.; Campbell, Mary K. |title=Biochemistry |publisher=Brooks Cole |location=Pacific Grove |year=2009 |isbn=0-495-39041-0 |edition=6th}}</ref>
== Opombe in reference ==
|
