SMILES: Razlika med redakcijama
Izbrisana vsebina Dodana vsebina
Primeri zapisov (delno) |
slika, drugi primeri |
||
Vrstica 26:
===Aromatičnost===
[[Slika:3-cyanoanisole SMILES.svg|right|thumb|350px|Prikaz kodiranja 3-cianoanizola v COc(c1)cccc1C#N.]]
Aromatski atomi C, O, S in N so prikazani z malimi črkami 'c', 'o', 's' in 'n'. [[Benzen]], [[piridin]] in [[furan]] se s SMILES zapišejo s c1ccccc1, n1ccccc1 in o1cccc1. Vezi med aromatskimi atomi so po dogovoru [[aromatičnost|aromatske]], vendar se lahko zapišejo zudi eksplicitno s simbolom ':'. Aromatski atomi so lahko med seboj povezani tudi z enojnimi vezmi, zato se [[bifenil]] lahko zapiše s c1ccccc1-c2ccccc2. Aromatski dušik, vezan na vodik, na primer v [[pirol]]u, mora biti zapisan z [nH]. [[Imidazol]] se zato v notaciji SMILES zapiše z n1c[nH]cc1.
Vrstica 115 ⟶ 116:
[[Slika:Cephalostatine-1.svg|center|360px|''Zgradba molekule cefalostatina-1'']]
Kodiranje se začne pri najbolj levi metilni skupini na zgornji sliki. SMILES cefalostatina-1 je:
<tt>C[C@@](C)(O1)C[C@@H](O)[C@@]1(O2)[C@@H](C)[C@@H]3CC=C4[C@]3(C2)C(=O)C[C@H]5[C@H]4CC[C@@H](C6)[C@]5(C)Cc(n7)c6nc(C[C@@]89(C))c7C[C@@H]8CC[C@@H]%10[C@@H]9C[C@@H](O)[C@@]%11(C)C%10=C[C@H](O%12)[C@]%11(O)[C@H](C)[C@]%12(O%13)[C@H](O)C[C@@]%13(C)CO</tt>
==Drugi primeri SMILES==
Notacija SMILES je obširno opisana v priročniku [http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smiles.html SMILES theory manual], ki ga je izdala družba [http://www.daylight.com/ Daylight Chemical Information Systems]. V priročniku so tudi številni izbrani primeri. Ena od rutin ([http://www.daylight.com/daycgi/depict depict utility]) omogoča uporabniku preverjanje njegovih primerov SMILES in je zato zelo uporabno orodje za učenje.
==Sklici==
| |||