Prepisovalni dejavnik: Razlika med redakcijama

Izbrisana vsebina Dodana vsebina
VolkovBot (pogovor | prispevki)
m robot Dodajanje: tr:Transkripsiyon faktörü
KocjoBot (pogovor | prispevki)
m pp, Replaced: ponavadi → po navadi (2)
Vrstica 10:
Pri [[evkarionti]]h so med [[vijačnica-zavoj-vijačnica]] proteini tudi homeodomenski proteini, ki imajo pomembno vlogo pri uravnavanju genskega izražanja med embrionalnim razvojem. Dve ostali družini DNK-vezavnih proteinov sta [[levcinska zadrga]] in [[vijačnica-obrat-vijačnica]] proteini, ki vsebujejo DNK-vezavno domeno, ki nastane z dimerizacijo dveh [[polipeptid]]nih verig. Levcinska zadrga vsebuje 4 ali 5 levcinskih ostankov, kar rezultira v hidrofobnih stranskih verigah, ki so izpostavljene na eni strani helikalne regije. Te regije služijo kot dimerizacijske domene za dve proteinski podenoti, ki skupaj vzdržujejo hidrofobne interakcije med levcinskimi stranskimi verigami. Takoj po levcinski zadrgi je regija bogata s pozitivno nabitimi aminokislinami ([[lizin]] in [[arginin]]), ki vežejo DNK. Vijačnica-obrat-vijačnica proteini imajo podobno strukturo, vendar se pri njih dimerizacijski domeni tvorita z helikalnimi regijami, ki sta ločeni z zavojem. Pomembno je namreč tudi dejstvo, da različni člani teh dveh družin (levcinska zadrga in vijačnica-obrat-vijačnica) lahko dimerizirajo med seboj. Nekatere aktivacijske domene imenovane, »kisle aktivacijske domene« so bogate z negativno nabitimi ostanki ([[aspartat]] in [[glutamat]]), drugi pa so bogati v [[prolin]]skih in [[glutamin]]skih ostankih. Te aktivacijske domene naj bi uravnavale transkripcijo tako, da interagirajo z bazalnimi transkripcijskimi faktorji (npr. [[TFIIB]] ali [[TFIID]]). Tako naj bi omogočili združitev transkripcijskega kompleksa na promotor [http://AtlasGeneticsOncology.org/Educ/TFactorsEng.html 1]
 
[[Gen]]i, ki jih prepiše [[RNK-polimeraza II]], imajo dva jedrna promotorja, [[TATA]] box in [[Inr]]-zaporedje, ki služita kot specifični vezavni mesti za transkripcijske faktorje. Ostala cis-delujoča regulatorna zaporedja služijo kot vezavna mesta za širok spekter regulatornih faktorjev, ki uravnavajo izražanje posameznih genov. Ta zaporedja se ponavadipo navadi nahajajo navzgor od TATA box-a. Dve zelo pogosti zaporedji sta CCAAT in GGGCGG, imenovani GC box [http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=146010 2]. V nasprotju z omenjenimi zaporedji so nekatera zaporedja oddaljena mnogo dlje od transkripcijskega začetnega mesta (včasih več kot 10 kilobaz). Ta zaporedja imenujemo »ojačevalci« (»enhancers«). Ojačevalci, tako kot promotorju, delujejo tako, da vežejo transkripcijski faktor, ki nato regulira RNK-polimerazo. To je možno zaradi tega, ker je DNK zvita. Vezava specifičnega transkripcijskega regulatornega proteina z ojačevalcem regulira gensko izražanje med razvojem in diferenciacijo. Pomembno dejstvo je tudi, da ojačevalci ponavadipo navadi vsebujejo multifunkcionalne elemente, ki vežejo različne transkripcijske regulatorne proteine. Tak primer najdemo pri imunoglobulinskem ojačevalcu [http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=331925 3]
 
{{biosci-stub}}